Bueno bueno bueno! Una vez más por aquí eh, persona curiosa! Hoy hablaremos de en qué consiste exactamente el test para el CORONAVIRUS.
Eso sí, si no has visto aún el vídeo te lo dejo a continuación para que lo veas ahora mismo.
Pues bien, una vez que ya te ha quedado más o menos claro, profundicemos un poco más en el asunto.
El test que se está haciendo hoy en día no es la PCR, realmente es la RT-qPCR. Voy a poneros en copia un texto que escribió Darío para aclararnos más el asunto:
Realmente, el test que se hace actualmente para diagnosticar a los pacientes de COVID-19 tendría una letra más en sus siglas, pasando a ser de RT-PCR como explicamos en el vídeo a RT-qPCR, donde la q significa “cuantitativa” (del inglés quantitative). Estas PCRs cuantitativas o “PCR a tiempo real” se realizan con la intención de obtener un dato que las PCRs normales no son capaces de revelar: la concentración de secuencia diana de la que partíamos al iniciar las pruebas.
No obstante, no es este el motivo por el que se usan para diagnosticar a los pacientes, la razón de su uso se halla en su rapidez. Para ver los resultados de una PCR normal deberíamos esperar a que se completaran los 30-35 ciclos y tras ello revelarlos en un gel de electroforesis, lo cual añadiría en torno a 40 minutos a la hora y algo que dura de por sí la PCR convencional. Mientras que, como su propio nombre indicia, con la qPCR podemos ver los resultados a tiempo real.
Esta maravilla que nos permite la biología molecular se debe a que en la mezcla hay un nuevo ingrediente, unos fluoróforos (moléculas que emiten fluorescencia) que se unirán a la secuencia de ADN cuando estén con la estructura de doble hélice. Por lo que, como tras cada ciclo se duplica el número de secuencias diana que había previamente, esta señal fluorescente también irá incrementando.
En la figura 1 tenemos un boceto de gráfica que nos permite ver fácilmente qué ocurriría en caso de que el paciente se encontrara, o no, infectado: en caso de no haber secuencia vírica en la muestra, no se daría ninguna ampliación durante los ciclos de la PCR y no habría señal fluorescente detectable. Mientras que en caso de infección, el aumento de señal sería tan drástico que no haría falta esperar a que se completaran todos los ciclos para poder hacer un diagnóstico claro. De modo que nos estaríamos ahorrando parte de lo que dura la PCR + lo que se tardaría en revelar los resultados en un gel de electroforesis.
Y si el post y el vídeo de hoy molan tanto es gracias a Darío, que además de ser muy buena persona es un divulgador brutal. Os recomiendo que le echéis un vistazo a su canal y aquí os dejo la segunda parte de la colaboración.
Fuentes:
https://ai4c.com/2020/01/24/rrt-pcr-a-method-to-confirm-wuhan-coronavirus-case/
Espy MJ, Uhl JR, Sloan LM, et al. Real-time PCR in clinical microbiology: applications for routine laboratory testing [published correction appears in Clin Microbiol Rev. 2006 Jul;19(3):595]. Clin Microbiol Rev. 2006;19(1):165–256. doi:10.1128/CMR.19.1.165-256.2006
Liu R, Han H, Liu F, Lv Z, Wu K, Liu Y, Feng Y, Zhu C.
Clin Chim Acta. 2020 Mar 7;505:172-175. doi: 10.1016/j.cca.2020.03.009. [Epub ahead of print]
